Cellosaurus SW954 (CVCL_1732)
Cell line name | SW954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-954; SW 954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW954 (RRID:CVCL_1732) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Vulva; UBERON=UBERON_0000997. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Vulvar squamous cell carcinoma (NCIt: C4052) Vulvar squamous cell carcinoma (ORDO: Orphanet_494448) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 86Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-117; Cosmic-CLP=924247; DepMap=ACH-001400 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=924690; DOI=10.1002/ijc.2910200505 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009204
CLO; CLO_0037166 cancercelllines; CVCL_1732 Cell_Model_Passport; SIDM01157 Cosmic-CLP; 924247 DepMap; ACH-001400 IGRhCellID; SW954 LINCS_LDP; LCL-1295 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471097 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307461
ChEMBL-Targets; CHEMBL614943 GDSC; 924247 PharmacoDB; SW954_1550_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1670517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 924247
IARC_TP53; 27255 Progenetix; CVCL_1732 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |