Cellosaurus SK-PN-DW (CVCL_1703)
Cell line name | SK-PN-DW | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SKPNDW | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1703 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SK-PN-DW (RRID:CVCL_1703) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. From: Memorial Sloan Kettering Cancer Center; New York; USA. Population: Caucasian. Karyotypic information: Has lost chromosome Y as well as one copy each of chromosomes 11, 13, 17 and 18 (PubMed=31046733). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Retroperitoneal space; UBERON=UBERON_0003693. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Primitive neuroectodermal tumor (NCIt: C3716) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 17Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2139; Cosmic-CLP=909731; ECACC=94092301 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.atcc.org/en/support/technical-support/faqs/morphology-of-atcc-crl-2139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2987426; DOI=10.1007/BF00165170 PubMed=3024811; DOI=10.1016/0165-4608(87)90084-7 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50006-X PubMed=8040301; DOI=10.1172/JCI117360; PMCID=PMC295111 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22142829; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-11-2056; PMCID=PMC3271129 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31046733; DOI=10.1186/s12885-019-5625-1; PMCID=PMC6498632 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 DOI=10.5282/edoc.27750 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2139
ECACC; 94092301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009064
CLDB; cl4358 cancercelllines; CVCL_1703 Cell_Model_Passport; SIDM01097 Cosmic-CLP; 909731 DepMap; ACH-001193 LINCS_LDP; LCL-1048 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472556
BioSample; SAMN10989621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308886
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366108 GDSC; 909731 PharmacoDB; SKPNDW_1412_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1703 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54954519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-3610
GEO; GSM1670456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 684073
Cosmic; 909731 Cosmic; 1078390 Cosmic; 1718431 IARC_TP53; 27245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |