Cellosaurus SiMa (CVCL_1695)
Cell line name | SiMa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SIMA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1695 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SiMa (RRID:CVCL_1695) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Biotechnology: Used in a bioassay to measure botulinum toxin serotype A (BoNT/B) activity. Together with the monoclonal antibody produced by hybridoma 2E2A6 (Cellosaurus=CVCL_RA98). Doubling time: 48-100 hours (PubMed=10686945); ~34-100 hours (Note=Highly variable) (DSMZ=ACC-164). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Adrenal gland; UBERON=UBERON_0002369. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adrenal gland neuroblastoma (NCIt: C4827) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 1Y8M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=753620; DSMZ=ACC-164; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10686945; DOI=10.1016/S0165-4608(98)00269-6 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23185348; DOI=10.1371/journal.pone.0049516; PMCID=PMC3504020 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009018
CLDB; cl4300 cancercelllines; CVCL_1695 Cell_Model_Passport; SIDM00395 Cosmic-CLP; 753620 DepMap; ACH-000099 DSMZCellDive; ACC-164 LINCS_LDP; LCL-1979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470930
BioSample; SAMN10988579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 469 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308828
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366067 GDSC; 753620 PharmacoDB; SIMA_1378_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1695 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54953497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM563363 GEO; GSM887572 GEO; GSM888655 GEO; GSM1366410 GEO; GSM1670423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 753620
Cosmic; 2485949 IARC_TP53; 27575 LiGeA; CCLE_027 Progenetix; CVCL_1695 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |