Cellosaurus Rh18 (CVCL_1659)
Cell line name | Rh18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RH18; RH-18; Rh-18; Rh 18; SJRH-18; SJRH18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_5918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Rh18 (RRID:CVCL_1659) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: NCI Pediatric Preclinical Testing Program (PPTP) cell line panel. Population: African American. Characteristics: Established from a immuno-deficient mice xenograft (HxRh18). Doubling time: 57.8 hours (PubMed=3607778); 83 hours (PubMed=20922763); ~60-70 hours (DSMZ=ACC-491); 65 hours (COG). Microsatellite instability: Instable (MSI-low) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Cell surface proteome. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Perineus, muscle; UBERON=UBERON_0002379. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Alveolar rhabdomyosarcoma (NCIt: C3749) Alveolar rhabdomyosarcoma (ORDO: Orphanet_99756) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 2Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): COG; Cosmic-CLP=971774; DSMZ=ACC-491; PubMed=20922763 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.cccells.org/PDF_Files/Rhabdomyosarcoma/Rh18%20Cell%20Line%20Data%20Sheet.pdf https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/r/cell-lines-detail-557.html http://www.pptpinvitro.org/cell_lines_panel.php | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6950170; DOI=10.1093/jnci/68.3.437 PubMed=3607778 CLPUB00569 PubMed=8275086; DOI=10.1038/ng1193-230 PubMed=8383879; DOI=10.1126/science.8383879 PubMed=7536457; DOI=10.1002/gcc.2870120305 PubMed=9802058 PubMed=9823299 PubMed=11051265 PubMed=19235922; DOI=10.1002/gcc.20655 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20922763; DOI=10.1002/pbc.22801; PMCID=PMC3005554 PubMed=23578105; DOI=10.1111/cas.12173; PMCID=PMC7657110 PubMed=23882450; DOI=10.3389/fonc.2013.00183; PMCID=PMC3713458 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=32758582; DOI=10.1016/j.gene.2020.145025 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 PubMed=36768928; DOI=10.3390/ijms24032601; PMCID=PMC9917031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_1659
Cell_Model_Passport; SIDM00454 Cosmic-CLP; 971774 DepMap; ACH-000689 DSMZCellDive; ACC-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473565
BioSample; SAMN10989566 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308533
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366350 GDSC; 971774 PharmacoDB; RH18_1311_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54950333 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM219745 GEO; GSM1670377 GEO; GSM1676325 GEO; GSM1701658 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687954
Cosmic; 801757 Cosmic; 802046 Cosmic; 971774 Cosmic; 1037296 Cosmic; 1048109 Cosmic; 1097747 Cosmic; 1104560 Cosmic; 1108739 Cosmic; 1509196 Cosmic; 1620037 IARC_TP53; 24981 IARC_TP53; 27702 LiGeA; CCLE_325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304
PRIDE; PXD039480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |