Cellosaurus NCI-H2196 (CVCL_1539)
Cell line name | NCI-H2196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | H2196; H-2196; NCIH2196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1539 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NCI-H2196 (RRID:CVCL_1539) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Lung small cell carcinoma (NCIt: C4917) Small cell lung cancer (ORDO: Orphanet_70573) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_2655 ! NCI-BL2195 CVCL_1538 ! NCI-H2195 CVCL_1540 ! NCI-H2198 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 67Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-5932; Cosmic-CLP=908481; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8806092; DOI=10.1002/jcb.240630505 PubMed=8806103; DOI=10.1002/jcb.240630516 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-5932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008063
cancercelllines; CVCL_1539 Cell_Model_Passport; SIDM00731 Cosmic-CLP; 908481 DepMap; ACH-000399 LINCS_LDP; LCL-1816 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473226
BioSample; SAMN10988344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308772
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075535 GDSC; 908481 PharmacoDB; NCIH2196_1077_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1539 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54907939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827562 GEO; GSM887413 GEO; GSM888492 GEO; GSM1670224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 688016
Cosmic; 877390 Cosmic; 908481 Cosmic; 1995563 Cosmic; 2125245 IARC_TP53; 21560 LiGeA; CCLE_104 Progenetix; CVCL_1539 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD011896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |