Cellosaurus NCI-H1993 (CVCL_1512)
Cell line name | NCI-H1993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | H1993; H-1993; NCIH1993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NCI-H1993 (RRID:CVCL_1512) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: 31.6 hours (PubMed=29681454). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_E102 ! NCI-BL1993 CVCL_1521 ! NCI-H2073 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 47Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-5909; Cosmic-CLP=908476; PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ https://www.atcc.org/en/support/technical-support/faqs/normal-morphology-and-growth-of-atcc-crl-5909-nci-h1993-cells | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8806092; DOI=10.1002/jcb.240630505 PubMed=10987304 PubMed=11030152; DOI=10.1038/sj.onc.1203815 PubMed=16187286; DOI=10.1002/ijc.21491 PubMed=18083107; DOI=10.1016/j.cell.2007.11.025 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112; PMCID=PMC3567922 PubMed=24297535; DOI=10.1142/9789814583220_0008; PMCID=PMC3940063 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028; PMCID=PMC5935540 PubMed=30038707; DOI=10.18632/oncotarget.25642; PMCID=PMC6049873 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-5909
NCI-DTP; NCI-H1993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008036
cancercelllines; CVCL_1512 Cell_Model_Passport; SIDM00758 Cosmic-CLP; 908476 DepMap; ACH-001137 IGRhCellID; NCIH1993 LINCS_LDP; LCL-1646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 959 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308138
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075527 GDSC; 908476 PharmacoDB; NCIH1993_1054_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54907897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM62328 GEO; GSM108831 GEO; GSM108832 GEO; GSM274706 GEO; GSM434315 GEO; GSM513952 GEO; GSM514337 GEO; GSM794341 GEO; GSM1670204 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687809
Cosmic; 877248 Cosmic; 903608 Cosmic; 908476 Cosmic; 980988 Cosmic; 1032460 Cosmic; 1146895 Cosmic; 1694669 Cosmic; 1870266 Cosmic; 1891898 Cosmic; 1995549 Cosmic; 2125239 Cosmic; 2630415 IARC_TP53; 21550 Progenetix; CVCL_1512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 43 |