Cellosaurus NB1 (CVCL_1440)
Cell line name | NB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | NB-1; NB-I; NB 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NB1 (RRID:CVCL_1440) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 40-50 hours (PubMed=174024); ~1 day (Note=Lot 12092005), ~32 hours (Note=Lot 09252019) (JCRB=IFO50295); ~60 hours (Note=Lot 120898), ~2 days (Note=Lot 08152016) (JCRB=JCRB0621). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Chromatin accessibility by ATAC-seq. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Cervical lymph node; UBERON=UBERON_0002429. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 2Y3M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=949179; JCRB=IFO50295; JCRB=JCRB0621; PubMed=25877200; RCB=RCB1953; TKG=TKG 0486 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | CLPUB00086 PubMed=4144593; DOI=10.1210/jcem-36-5-931 PubMed=174024 PubMed=201151; DOI=10.1111/j.1440-1827.1977.tb00186.x PubMed=590688; DOI=10.20772/cancersci1959.68.5_711 DOI=10.1016/B978-0-12-008304-6.50015-4 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=11129446; DOI=10.1097/00019606-200012000-00007 PubMed=12210830; DOI=10.1002/jnr.10330 PubMed=12702577 PubMed=18923524; DOI=10.1038/nature07399 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; IFO50295
JCRB; JCRB0621 RCB; RCB1953 TKG; TKG 0486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0051419
cancercelllines; CVCL_1440 Cell_Model_Passport; SIDM00578 CGH-DB; 74-1 CGH-DB; 9097-4 Cosmic-CLP; 949179 DepMap; ACH-000804 LINCS_LDP; LCL-1977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470966
BioSample; SAMN03472043 BioSample; SAMN10988531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 949179
PharmacoDB; NB1_984_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54907515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022502 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM333816 GEO; GSM333825 GEO; GSM887348 GEO; GSM888425 GEO; GSM1670145 GEO; GSM2371241 GEO; GSM2394388 GEO; GSM4104581 GEO; GSM4104582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 801736
Cosmic; 920243 Cosmic; 947696 Cosmic; 949179 Cosmic; 1037339 Cosmic; 1099136 Cosmic; 1153784 Cosmic; 1526632 Cosmic; 2131573 IARC_TP53; 27699 LiGeA; CCLE_099 Progenetix; CVCL_1440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |