Cellosaurus LCLC-97TM1 (CVCL_1376)
Cell line name | LCLC-97TM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LCLC97TM1; Large Cell Lung Cancer-97TM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LCLC-97TM1 (RRID:CVCL_1376) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: NCI RAS program mutant KRAS cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: 26 hours (PubMed=2840315); >50 hours (DSMZ=ACC-388). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: LCL97TM; PubMed=26361996. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung large cell carcinoma (NCIt: C4450) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 44Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CLS=300409; Cosmic-CLP=946361; DSMZ=ACC-388; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2840315; DOI=10.1111/j.1432-0436.1988.tb00806.x PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=26361996; DOI=10.1016/j.jprot.2015.09.003 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CLS; 300409
DSMZ; ACC-388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007283
cancercelllines; CVCL_1376 Cell_Model_Passport; SIDM00344 Cosmic-CLP; 946361 DepMap; ACH-000596 DSMZCellDive; ACC-388 IGRhCellID; LCLC97TM1GEO LINCS_LDP; LCL-1782 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473042
BioSample; SAMN03473572 BioSample; SAMN10988572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308112
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075489 GDSC; 946361 PharmacoDB; LCLC97TM1_834_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54902346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006635 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM434288 GEO; GSM784234 GEO; GSM887265 GEO; GSM888340 GEO; GSM1670046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 946361
Cosmic; 1146948 Cosmic; 1995482 IARC_TP53; 27176 LiGeA; CCLE_643 Progenetix; CVCL_1376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD002556
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |