Cellosaurus LC4-1 (CVCL_1374)
Cell line name | LC4-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LC41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LC4-1 (RRID:CVCL_1374) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=10739008; PubMed=11226526; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Miscellaneous: STR profile from personal communication of Leo, Isabelle Rose. Misspelling: LC4-L1; PubMed=35124168. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Childhood B acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C9140) Precursor B-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99860) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 13Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907787; JCRB=JCRB0114; Direct_author_submission Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3115091; DOI=10.1002/ajh.2830260106 PubMed=10233379; DOI=10.1111/j.1365-2141.1999.01284.x PubMed=10739008; DOI=10.1016/S0145-2126(99)00182-4 PubMed=11226526; DOI=10.1016/S0145-2126(00)00121-1 PubMed=14504097; DOI=10.1182/blood-2003-02-0418 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35124168; DOI=10.1016/j.jsbmb.2022.106068 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB0114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009846
cancercelllines; CVCL_1374 Cell_Model_Passport; SIDM00549 Cosmic-CLP; 907787 DepMap; ACH-002267 LINCS_LDP; LCL-1037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308835
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366091 GDSC; 907787 PharmacoDB; LC41_832_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54902172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827293 GEO; GSM1670044 GEO; GSM5137723 GEO; GSM5137760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907787
Cosmic; 996283 Cosmic; 998692 Cosmic; 1037719 IARC_TP53; 21471 Progenetix; CVCL_1374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |