Cellosaurus Karpas-45 (CVCL_1326)
Cell line name | Karpas-45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | KARPAS-45; Karpas 45; KARPAS 45; KARPAS45; K45; T-45; T45; Line 45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Karpas-45 (RRID:CVCL_1326) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 50-100 hours (ECACC=06072602). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=31068700). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. Cell type: T-cell; CL=CL_0000084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Childhood T acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C7953) Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99861) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 2Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907272; DSMZ=ACC-105 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1016/0145-2126(77)90063-7 DOI=10.1007/978-1-4613-2823-0_29 PubMed=3264071; DOI=10.1073/pnas.85.23.9229; PMCID=PMC282712 PubMed=9933131; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00133-7 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=14671638; DOI=10.1038/sj.leu.2403236 PubMed=15472075; DOI=10.1126/science.1102160 PubMed=15843827; DOI=10.1038/sj.leu.2403749 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=17170727; DOI=10.1038/sj.leu.2404486 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22675565; DOI=10.1371/journal.pone.0038463; PMCID=PMC3366948 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-105 - Discontinued
ECACC; 06072602 NCBI_Iran; C180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007067
CLDB; cl35 cancercelllines; CVCL_1326 Cell_Model_Passport; SIDM01007 Cosmic-CLP; 907272 DepMap; ACH-002256 DSMZCellDive; ACC-105 LINCS_LDP; LCL-1015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308305
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366305 GDSC; 907272 PharmacoDB; KARPAS45_731_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54899501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669977 GEO; GSM5137719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907272
Cosmic; 913413 Cosmic; 1012075 Cosmic; 1151781 Cosmic; 1175130 Cosmic; 1191704 Cosmic; 1281370 Cosmic; 1330505 Cosmic; 1524799 Cosmic; 1664523 Cosmic; 1760525 Cosmic; 2165714 Cosmic; 2391812 Cosmic; 2602917 IARC_TP53; 27173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |