Cellosaurus IMR-5 (CVCL_1306)
Cell line name | IMR-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | IMR 5; IMR5; IMR-05; Institute for Medical Research-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: IMR-5 (RRID:CVCL_1306) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Abdomen; UBERON=UBERON_0000916. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0346 (IMR-32) Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 1Y1M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907170; PubMed=31581737 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6160155; DOI=10.1016/S0021-9258(19)70222-1 PubMed=12536080; DOI=10.1016/S0304-3835(02)00581-5 PubMed=15150091; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-03-0809 PubMed=16822308; DOI=10.1186/1471-2407-6-177; PMCID=PMC1533846 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261; PMCID=PMC2672043 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=23202128; DOI=10.1038/ng.2493; PMCID=PMC3557959 PubMed=24466371; DOI=10.1593/tlo.13544; PMCID=PMC3890703 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31581737; DOI=10.3390/cells8101194; PMCID=PMC6830094 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ICLC; HTL00009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0006950
CLDB; cl5097 cancercelllines; CVCL_1306 Cell_Model_Passport; SIDM01206 Cosmic-CLP; 907170 DepMap; ACH-002248 LINCS_LDP; LCL-1984 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308201
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366209 GDSC; 907170 PharmacoDB; IMR5_660_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54897648 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669935 GEO; GSM2371236 GEO; GSM2394389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907170
Cosmic; 1019939 Cosmic; 1109364 Cosmic; 1161989 Cosmic; 1167417 Cosmic; 1890113 IARC_TP53; 21396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |