Cellosaurus IGR-1 (CVCL_1303)
Cell line name | IGR-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | IGR 1; IGR1; Institut Gustave Roussy-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: IGR-1 (RRID:CVCL_1303) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~75-100 hours (DSMZ=ACC-236). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Inguinal lymph node; UBERON=UBERON_0001542. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: CLS=300219
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cutaneous melanoma (NCIt: C3510) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 42Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CLS=300219; Cosmic-CLP=907169; DSMZ=ACC-236; PubMed=25056119; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4153924 PubMed=954556; DOI=10.1016/0014-2964(76)90033-5 PubMed=405430; DOI=10.1111/1523-1747.ep12496554 PubMed=6929009; DOI=10.1093/jnci/64.5.1029 PubMed=1822769; DOI=10.1097/00008390-199104000-00002 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25056119; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-14-1232-T; PMCID=PMC4167745 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CLS; 300219
CLS; 300219-SF DSMZ; ACC-236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0006669
CLDB; cl2624 cancercelllines; CVCL_1303 Cell_Model_Passport; SIDM01060 Cosmic-CLP; 907169 DepMap; ACH-000882 DSMZCellDive; ACC-236 LINCS_LDP; LCL-1247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472901
BioSample; SAMN10987998 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308749
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075479 GDSC; 907169 PharmacoDB; IGR1_651_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54897358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887157 GEO; GSM888229 GEO; GSM1669927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907169
Cosmic; 2230115 IARC_TP53; 21394 LiGeA; CCLE_169 Progenetix; CVCL_1303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |