Cellosaurus HuO9 (CVCL_1298)
Cell line name | HuO9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Huo9; HUO9; Hu09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HuO9 (RRID:CVCL_1298) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Characteristics: Established from a xenograft established in athymic nude mice after five passages. Doubling time: 57 hours (PubMed=2170070); 43.3 hours (PubMed=14669798). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Bone, right distal femur; UBERON=UBERON_0004406. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=15289353
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Osteosarcoma (NCIt: C9145) Osteosarcoma (ORDO: Orphanet_668) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Originate from same individual | CVCL_2958 ! HuO9N2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 13Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907072; DepMap=ACH-001526; JCRB=JCRB0427 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2691514; DOI=10.1007/BF00391353 PubMed=2170070; DOI=10.1097/00003086-199010000-00036 DOI=10.11418/jtca1981.16.3_173 PubMed=9359923; DOI=10.18926/AMO/30789 PubMed=12405284; DOI=10.1023/A:1020395816633 PubMed=14669798; DOI=10.1023/A:1027355610603 PubMed=15289353; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-04-0522 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=26320182; DOI=10.18632/oncotarget.5177; PMCID=PMC4745740 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29334376; DOI=10.1038/nm.4475; PMCID=PMC5803371 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB0427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009875
cancercelllines; CVCL_1298 Cell_Model_Passport; SIDM00599 Cosmic-CLP; 907072 DepMap; ACH-001526 LINCS_LDP; LCL-1423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308748
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075476 GDSC; 907072 PharmacoDB; HuO9_643_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54896887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM320823 GEO; GSM1669921 GEO; GSM1676303 GEO; GSM1701638 GEO; GSM1914988 GEO; GSM1914989 GEO; GSM1914990 GEO; GSM1914991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907072
Cosmic; 931040 IARC_TP53; 21390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |