Cellosaurus HT-3 (CVCL_1293)
Cell line name | HT-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HT3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HT-3 (RRID:CVCL_1293) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. From: Memorial Sloan Kettering Cancer Center; New York; USA. Registration: Memorial Sloan Kettering Cancer Center Office of Technology Development; SK 784-01. Population: Caucasian. Doubling time: 2.48 days (PubMed=29156801). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10611; Human papillomavirus type 30 (HPV30). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: Indicated as originating from a 58 year old female patient in ATCC and from a 53 year old in Sloan Kettering tech transfer site. Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=77569
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cervical carcinoma (NCIt: C9039) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-32; Cosmic-CLP=907068; DepMap=ACH-001525; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.mskcc.org/research-advantage/support/technology/tangible-material/ht-3-human-cervical-cell-line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1007/978-1-4757-1647-4_5 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=924690; DOI=10.1002/ijc.2910200505 PubMed=77569; DOI=10.1111/j.1399-0039.1978.tb01259.x PubMed=7459858 PubMed=6220172 PubMed=2990217; PMCID=PMC1888002 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=1648218; DOI=10.1073/pnas.88.13.5523; PMCID=PMC51909 PubMed=10392903 PubMed=15531914; DOI=10.1038/sj.onc.1208235 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=24134916; DOI=10.1186/1755-8166-6-44; PMCID=PMC3879223 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29156801; DOI=10.18632/oncotarget.21174; PMCID=PMC5689691 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0004286
cancercelllines; CVCL_1293 Cell_Model_Passport; SIDM00679 Cosmic-CLP; 907068 DepMap; ACH-001525 IGRhCellID; HT3 LINCS_LDP; LCL-1304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308745
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075470 GDSC; 907068 PharmacoDB; HT3_631_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54896535 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002204 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM253299 GEO; GSM675735 GEO; GSM685442 GEO; GSM1669914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 760222
Cosmic; 809227 Cosmic; 846183 Cosmic; 907068 Cosmic; 925353 Cosmic; 928908 Cosmic; 1131521 Cosmic; 1193036 Cosmic; 1201774 Cosmic; 1995449 Cosmic; 2301540 Cosmic; 2660191 Cosmic; 2816219 IARC_TP53; 325 Progenetix; CVCL_1293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |