Cellosaurus HT-1376 (CVCL_1292)
Cell line name | HT-1376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HT1376; HT 1376; HT 1376.T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HT-1376 (RRID:CVCL_1292) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: BLA-40 bladder carcinoma cell line panel. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Part of: UBC-40 urothelial bladder cancer cell line index. Population: Caucasian. Doubling time: 31 hours (PubMed=3708594); 31 hours (PubMed=26055179); ~60 hours (DSMZ=ACC-397). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: HT-137; ChEMBL-Targets=CHEMBL614664; ChEMBL-Cells=CHEMBL3308610. Misspelling: HT-1367; PubMed=29732388. Derived from site: In situ; Urinary bladder; UBERON=UBERON_0001255. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Bladder carcinoma (NCIt: C4912) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-1472; Cosmic-CLP=907066; DSMZ=ACC-397; ECACC=87032402; KCLB=21472; PubMed=11416159; PubMed=27270441 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.synapse.org/UC25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=191628; DOI=10.1093/jnci/58.4.881 PubMed=6244232 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=3708594 PubMed=7787250 PubMed=8873383; DOI=10.1007/BF00295899 PubMed=9850064 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23401075; DOI=10.1002/path.4176 PubMed=24367658; DOI=10.1371/journal.pone.0084411; PMCID=PMC3867501 PubMed=24035680; DOI=10.1016/j.eururo.2013.08.057 PubMed=24459064; DOI=10.1007/s13277-013-1604-3 PubMed=25997541; DOI=10.1186/s12864-015-1450-3; PMCID=PMC4470036 PubMed=26055179; DOI=10.1016/j.tranon.2015.04.002; PMCID=PMC4487788 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=27270441; DOI=10.1038/onc.2016.172; PMCID=PMC5140783 PubMed=29732388; DOI=10.3233/BLC-180167; PMCID=PMC5929350 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-1472
ATCC; CRL-7927 - Discontinued BCRC; 60058 CLS; 305100 DSMZ; ACC-397 ECACC; 87032402 IZSLER; BS TCL 70 KCLB; 21472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0004268
CLO; CLO_0004279 CLDB; cl1743 CLDB; cl1744 cancercelllines; CVCL_1292 Cell_Model_Passport; SIDM00678 Cosmic-CLP; 907066 DepMap; ACH-000724 DSMZCellDive; ACC-397 IGRhCellID; HT1376 LINCS_LDP; LCL-1712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821564
BioSample; SAMN01821635 BioSample; SAMN03472820 BioSample; SAMN10988225 ENCODE; ENCBS266UUE ENCODE; ENCBS956LPK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308398
ChEMBL-Cells; CHEMBL3308610 ChEMBL-Targets; CHEMBL612258 ChEMBL-Targets; CHEMBL614664 GDSC; 907066 PharmacoDB; HT1376_628_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54896503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM136230 GEO; GSM142305 GEO; GSM142310 GEO; GSM827432 GEO; GSM887139 GEO; GSM888210 GEO; GSM1374560 GEO; GSM1574553 GEO; GSM1669911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 715761
Cosmic; 760481 Cosmic; 845562 Cosmic; 907066 Cosmic; 925821 Cosmic; 928815 Cosmic; 943733 Cosmic; 1046691 Cosmic; 1285118 Cosmic; 1285987 Cosmic; 1927303 Cosmic; 2050444 Cosmic; 2057449 Cosmic; 2444252 Cosmic; 2686096 IARC_TP53; 3720 LiGeA; CCLE_036 Progenetix; CVCL_1292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 45 |