Cellosaurus HCE-T (CVCL_1272)
Cell line name | HCE-T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCET; Human Corneal Epithelial cells-Transformed; HCE; SV40-HCEC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCE-T (RRID:CVCL_1272) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Japanese. Doubling time: 24.4 hours (PubMed=7534282). Transformant: Ad-SV40 hybrid virus. Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Eye, cornea, epithelium; UBERON=UBERON_0001772. Cell type: Epithelial cell of cornea; CL=CL_0000575. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 49Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Transformed cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=26900324; PubMed=29787296; RCB=RCB2280 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7534282 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=26900324; PMCID=PMC4734150 PubMed=28315467; DOI=10.1016/j.ejps.2017.03.018 DOI=10.22028/D291-35665 PubMed=29787296; DOI=10.1080/02713683.2018.1480043; PMCID=PMC6590053 PubMed=31927639; DOI=10.1007/s00417-019-04563-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | BCRJ; 0349 - Discontinued
RCB; RCB1384 - Discontinued RCB; RCB2280 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0050405
CLO; CLO_0050406 Cell_Model_Passport; SIDM00075 DepMap; ACH-002336 FCS-free; 4-2-4-2-4-3 FCS-free; 4-2-6-1-4-3 LINCS_LDP; LCL-1047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0006396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308200
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366139 PharmacoDB; HCET_516_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSE73060 GEO; GSM1669867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907049
IARC_TP53; 27695 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |