Cellosaurus HAL-01 (CVCL_1242)
Cell line name | HAL-01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HAL-O1; HAL01; HAL-1; HALO1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HAL-01 (RRID:CVCL_1242) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 32 hours (PubMed=2027299); ~48 hours (DSMZ=ACC-610). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=10739008; PubMed=11226526; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | B acute lymphoblastic leukemia with TCF3-HLF rearrangement (NCIt: C199241) B-lymphoblastic leukemia/lymphoma with t(17;19) (ORDO: Orphanet_641375) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 17Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=949153; DSMZ=ACC-610; RCB=RCB0540 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2027299 PubMed=1516826; DOI=10.1101/gad.6.9.1608 DOI=10.11418/jtca1981.15.4_211 PubMed=9680106; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00050-2 PubMed=10739008; DOI=10.1016/S0145-2126(99)00182-4 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=11226526; DOI=10.1016/S0145-2126(00)00121-1 PubMed=14504097; DOI=10.1182/blood-2003-02-0418 PubMed=20147975; DOI=10.1038/leu.2010.8 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20519628; DOI=10.1182/blood-2009-09-244673 PubMed=20575032; DOI=10.1002/ajh.21738; PMCID=PMC7159455 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29786757; DOI=10.1007/s12185-018-2474-7 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35124168; DOI=10.1016/j.jsbmb.2022.106068 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CLS; 305140
DSMZ; ACC-610 KCB; KCB 94011YJ RCB; RCB0540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0050976
cancercelllines; CVCL_1242 Cell_Model_Passport; SIDM00289 Cosmic-CLP; 949153 DepMap; ACH-002241 DSMZCellDive; ACC-610 LINCS_LDP; LCL-1046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821626
BioSample; SAMN03473501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308233
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366142 GDSC; 949153 PharmacoDB; HAL01_441_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54872387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669838 GEO; GSM5137716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 949153
Cosmic; 996300 Cosmic; 998738 Cosmic; 999742 Cosmic; 1037744 IARC_TP53; 27557 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |