Cellosaurus H4 (CVCL_1239)
Cell line name | H4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | H-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: H4 (RRID:CVCL_1239) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: PTEN genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1030). Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Miscellaneous: Originally classified as originating from a neuroglioma, an obsolete classification. This cell line has been reclassified as an astrocytoma. Derived from site: In situ; Brain; UBERON=UBERON_0000955. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Astrocytoma (NCIt: C60781) Astrocytoma (ORDO: Orphanet_94) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 37Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-148; CCRID; CLS=300184; Cosmic-CLP=907042 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-293.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4544026; DOI=10.1093/jnci/52.1.71 PubMed=6256643; DOI=10.1038/288724a0 PubMed=6500159; DOI=10.1159/000163283 DOI=10.1007/0-306-46861-1_11 PubMed=10074188; DOI=10.1128/JVI.73.4.3338-3350.1999; PMCID=PMC104098 PubMed=10560660; DOI=10.1097/00005072-199911000-00007 PubMed=11414198; DOI=10.1007/s004320000207 PubMed=11508811; DOI=10.1023/A:1010680920087 PubMed=19435942; DOI=10.1215/15228517-2009-025; PMCID=PMC2743214 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2; PMCID=PMC6687785 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-148
BCRJ; 0263 CCTCC; GDC0128 CLS; 300184 IZSLER; BS TCL 102 KCB; KCB 2012027YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003599
CLDB; cl5193 cancercelllines; CVCL_1239 CCRID; 1101HUM-PUMC000372 CCRID; 4201HUM-CCTCC00128 Cell_Model_Passport; SIDM00852 Cosmic-CLP; 907042 DepMap; ACH-000389 IGRhCellID; H4 LINCS_LDP; LCL-1401 Lonza; 285 TOKU-E; 1367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472722
BioSample; SAMN10987915 ENCODE; ENCBS381KGR ENCODE; ENCBS836LDB ENCODE; ENCBS902ISQ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 430 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308507
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075452 GDSC; 907042 PharmacoDB; H4_437_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54872126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM326236 GEO; GSM887031 GEO; GSM888101 GEO; GSM1669834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687571
Cosmic; 849856 Cosmic; 907042 Cosmic; 1610749 Cosmic; 1746955 Cosmic; 2060805 Cosmic; 2302320 Cosmic; 2367529 IARC_TP53; 21355 LiGeA; CCLE_383 Progenetix; CVCL_1239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |