Cellosaurus GI-1 (CVCL_1231)
Cell line name | GI-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | GI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: GI-1 (RRID:CVCL_1231) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 18 hours (PubMed=1545891). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Brain, left fronto-parietal lobe. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gliosarcoma (NCIt: C3796) Gliosarcoma (ORDO: Orphanet_251576) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 61Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=906871; PubMed=25877200; RCB=RCB0763 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1545891; DOI=10.1097/00006123-199202000-00013 DOI=10.1007/0-306-46861-1_11 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | RCB; RCB0763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0050634
cancercelllines; CVCL_1231 Cell_Model_Passport; SIDM00273 Cosmic-CLP; 906871 DepMap; ACH-000756 LINCS_LDP; LCL-1379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470902
BioSample; SAMN10987799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308167
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366272 GDSC; 906871 PharmacoDB; GI1_404_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54835802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887024 GEO; GSM888094 GEO; GSM1669809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687569
Cosmic; 906871 Cosmic; 2367527 IARC_TP53; 21343 LiGeA; CCLE_649 Progenetix; CVCL_1231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |