Cellosaurus GCT (CVCL_1229)
Cell line name | GCT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | Giant Cell Tumor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: GCT (RRID:CVCL_1229) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Tumor Immunology Bank (TIB) collection from Salk (transferred to ATCC in 1981). Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Undifferentiated pleomorphic sarcoma (NCIt: C4247) Undifferentiated pleomorphic sarcoma (ORDO: Orphanet_2023) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 29Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=TIB-223; CLS=300155; Cosmic-CLP=906999; IZSLER=BS TCL 94 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7689482 PubMed=12068308; DOI=10.1038/nature00766 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; TIB-223
BCRC; 60474 CLS; 300155 IZSLER; BS TCL 94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003464
CLDB; cl1445 cancercelllines; CVCL_1229 Cell_Model_Passport; SIDM00853 Cosmic-CLP; 906999 DepMap; ACH-000835 IGRhCellID; GCT LINCS_LDP; LCL-1752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471887
BioSample; SAMN10987909 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308471
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075448 GDSC; 906999 PharmacoDB; GCT_401_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54835514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM184402 GEO; GSM184403 GEO; GSM827496 GEO; GSM887022 GEO; GSM888092 GEO; GSM1669807 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 684227
Cosmic; 906999 IARC_TP53; 21341 LiGeA; CCLE_019 Progenetix; CVCL_1229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |