Cellosaurus GA-10 (CVCL_1222)
Cell line name | GA-10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | GA10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: GA-10 (RRID:CVCL_1222) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Virology: EBV-negative. Doubling time: ~24 hours (PubMed=11482875). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Virome analysis using RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: B-cell; CL=CL_0000236. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult Burkitt leukemia (NCIt: C7954) Burkitt lymphoma (ORDO: Orphanet_543) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 41Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2392; Cosmic-CLP=1303896; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=11482875; DOI=10.1006/bcmd.2001.0428 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25355872; DOI=10.1128/JVI.02570-14; PMCID=PMC4301145 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003439
cancercelllines; CVCL_1222 Cell_Model_Passport; SIDM00854 Cosmic-CLP; 1303896 DepMap; ACH-000162 IGRhCellID; GA10 LINCS_LDP; LCL-2020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473120
BioSample; SAMN10987941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4523538
ChEMBL-Targets; CHEMBL4523569 GDSC; 1303896 PharmacoDB; GA10_395_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54835415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002181 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827343 GEO; GSM887019 GEO; GSM888088 GEO; GSM1669801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1303896
IARC_TP53; 16698 LiGeA; CCLE_930 Progenetix; CVCL_1222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |