Cellosaurus DOK (CVCL_1180)
Cell line name | DOK | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Dysplastic Oral Keratinocyte | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: DOK (RRID:CVCL_1180) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~40 hours (PubMed=1459732). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Oral cavity, tongue; UBERON=UBERON_0001723. Cell type: Keratinocyte; CL=CL_0000312. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Oral epithelial dysplasia (NCIt: C129863) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 57Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=910936; ECACC=94122104; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1459732; DOI=10.1002/ijc.2910520612 PubMed=7917902; DOI=10.1038/bjc.1994.356; PMCID=PMC2033430 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25169794; DOI=10.1111/jop.12236 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26234610; DOI=10.1038/srep12668; PMCID=PMC4522661 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CancerTools; 153251
ECACC; 94122104 - Discontinued Ximbio; 153251 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002806
CLDB; cl1087 cancercelllines; CVCL_1180 Cell_Model_Passport; SIDM00540 Cosmic-CLP; 910936 DepMap; ACH-002234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308727
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075435 GDSC; 910936 PharmacoDB; DOK_304_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54831351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006564 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827453 GEO; GSM1374468 GEO; GSM1431134 GEO; GSM1669741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 910936
Cosmic; 1339915 IARC_TP53; 21311 Progenetix; CVCL_1180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |