Cellosaurus CPC-N (CVCL_1146)
Cell line name | CPC-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CPC.N; CPCN; CPN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CPC-N (RRID:CVCL_1146) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~4 days (DSMZ=ACC-306). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung small cell carcinoma (NCIt: C4917) Small cell lung cancer (ORDO: Orphanet_70573) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=753547; DSMZ=ACC-306; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1318772 CLPUB00547 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002602
cancercelllines; CVCL_1146 Cell_Model_Passport; SIDM00953 Cosmic-CLP; 753547 DepMap; ACH-001049 DSMZCellDive; ACC-306 LINCS_LDP; LCL-1829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473098
BioSample; SAMN10988109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308830
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366061 GDSC; 753547 PharmacoDB; CPCN_263_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54814384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM784202 GEO; GSM886967 GEO; GSM888036 GEO; GSM1669708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 753547
Cosmic; 1995380 IARC_TP53; 21256 Progenetix; CVCL_1146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |