Cellosaurus CHL-1 (CVCL_1122)
Cell line name | CHL-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CHL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CHL-1 (RRID:CVCL_1122) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Patented cell line. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ERK genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1033). Registration: International Depositary Authority, American Type Culture Collection (ATCC); CRL-9446. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Melanoma (NCIt: C3224) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_2713 (RPMI-7932) Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 36Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-3619; Cosmic-CLP=910853; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | Patent=US5017478 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22178978; DOI=10.1016/j.freeradbiomed.2011.11.019 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23637631; DOI=10.1371/journal.pgen.1003464; PMCID=PMC3636093 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-3619
ATCC; CRL-9446 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002420
cancercelllines; CVCL_1122 Cell_Model_Passport; SIDM01228 Cosmic-CLP; 910853 DepMap; ACH-001024 IGRhCellID; CHL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470897
BioSample; SAMN10988230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308722
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075422 GDSC; 910853 PharmacoDB; CHL1_197_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54812129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM886928 GEO; GSM887994 GEO; GSM1669675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 706115
Cosmic; 897494 Cosmic; 910853 Cosmic; 1459665 Cosmic; 1477418 Cosmic; 1995367 IARC_TP53; 21224 Progenetix; CVCL_1122 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |