Cellosaurus CAL-39 (CVCL_1109)
Cell line name | CAL-39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CAL 39; CAL39; Centre Antoine Lacassagne-39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CAL-39 (RRID:CVCL_1109) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 30 hours (Note=At 34th passage) (PubMed=21573363); ~50-70 hours (DSMZ=ACC-187). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Vulva; UBERON=UBERON_0000997. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Vulvar squamous cell carcinoma (NCIt: C4052) Vulvar squamous cell carcinoma (ORDO: Orphanet_494448) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 76Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=924107; DSMZ=ACC-187 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=21573363; DOI=10.3892/ijo.3.2.293 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002184
CLDB; cl630 cancercelllines; CVCL_1109 Cell_Model_Passport; SIDM00935 Cosmic-CLP; 924107 DepMap; ACH-002091 DSMZCellDive; ACC-187 LINCS_LDP; LCL-1294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308716
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075410 GDSC; 924107 PharmacoDB; CAL39_171_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 924107
Cosmic; 1995358 IARC_TP53; 27146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |