Cellosaurus CAL-148 (CVCL_1106)
Cell line name | CAL-148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CAL 148; CAL148; Centre Antoine Lacassagne-148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CAL-148 (RRID:CVCL_1106) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: JWGray breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~30-40 hours (DSMZ=ACC-460); 42.78 hours (JWGray panel). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Breast carcinoma (NCIt: C4872) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 58Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=924106; DSMZ=ACC-460; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7531416 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110; PMCID=PMC3937590 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002181
cancercelllines; CVCL_1106 Cell_Model_Passport; SIDM00938 Cosmic-CLP; 924106 DepMap; ACH-000902 DSMZCellDive; ACC-460 LINCS_HMS; 51111 LINCS_LDP; LCL-1464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471761
BioSample; SAMN10988460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308794
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075407 GDSC; 924106 PharmacoDB; CAL148_167_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM274695 GEO; GSM344383 GEO; GSM344433 GEO; GSM783978 GEO; GSM827186 GEO; GSM886906 GEO; GSM887971 GEO; GSM1172945 GEO; GSM1669647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 924106
Cosmic; 1603194 Cosmic; 2164985 IARC_TP53; 27145 LiGeA; CCLE_805 Progenetix; CVCL_1106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |