Cellosaurus BEN (CVCL_1082)
Cell line name | BEN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_1082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BEN (RRID:CVCL_1082) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 3.5 days (PubMed=1233082); ~40-50 hours (DSMZ=ACC-254). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: 1BEN; Cosmic=1188583. Derived from site: Metastatic; Supraclavicular lymph node; UBERON=UBERON_0035279. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung non-small cell carcinoma (NCIt: C2926) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 71Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=753534; DSMZ=ACC-254; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1233082; DOI=10.1038/bjc.1975.237; PMCID=PMC2024744 PubMed=7171457; DOI=10.1038/bjc.1982.272; PMCID=PMC2011156 PubMed=10908148; DOI=10.1038/labinvest.3780108 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001926
CLDB; cl414 cancercelllines; CVCL_1082 Cell_Model_Passport; SIDM00990 Cosmic-CLP; 753534 DepMap; ACH-000603 DSMZCellDive; ACC-254 LINCS_LDP; LCL-1602 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0000253 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473096
BioSample; SAMN03473332 BioSample; SAMN10988541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308709
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075395 GDSC; 753534 PharmacoDB; BEN_87_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54795995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM784239 GEO; GSM827594 GEO; GSM886878 GEO; GSM887943 GEO; GSM1669616 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 753534
Cosmic; 1188583 Cosmic; 1995344 Cosmic; 2058651 IARC_TP53; 21181 LiGeA; CCLE_786 Progenetix; CVCL_1082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |