Cellosaurus BC-1 (CVCL_1079)
Cell line name | BC-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | BC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BC-1 (RRID:CVCL_1079) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~35-48 hours (DSMZ=ACC-677). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Transformant: NCBI_TaxID; 37296; Human herpesvirus 8 (HHV-8/KSHV). Omics: Array-based CGH. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. Cell type: B-cell; CL=CL_0000236. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Primary effusion lymphoma (NCIt: C6915) Primary effusion lymphoma (ORDO: Orphanet_48686) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_4221 ! HBL-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 46Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2230; Cosmic-CLP=910919; DSMZ=ACC-677 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.cells-talk.com/index.php/page/copelibrary?key=BC-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7670109; DOI=10.1182/blood.V86.7.2708.2708 PubMed=8523568; DOI=10.1128/JVI.70.1.549-558.1996; PMCID=PMC189843 PubMed=9766492; DOI=10.1038/sj.leu.2401160 Patent=US5908773 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=15613351; DOI=10.1128/JVI.79.2.1244-1251.2005; PMCID=PMC538532 PubMed=17121789; DOI=10.1128/JVI.01757-06; PMCID=PMC1797584 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=21685375; DOI=10.1182/blood-2010-12-323659; PMCID=PMC3158728 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 PubMed=36094314; DOI=10.1128/JVI.00739-22; PMCID=PMC9517713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2230
DSMZ; ACC-677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001887
cancercelllines; CVCL_1079 Cell_Model_Passport; SIDM00896 Cosmic-CLP; 910919 DepMap; ACH-002214 DSMZCellDive; ACC-677 IGRhCellID; BC1 LINCS_LDP; LCL-1956 Lonza; 914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471843
BioSample; SAMN03473432 BioSamples; SAMEA365796 BioSamples; SAMEA365808 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307907
ChEMBL-Targets; CHEMBL614277 GDSC; 910919 PharmacoDB; BC1_77_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54795185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM33136 GEO; GSM38792 GEO; GSM38793 GEO; GSM634731 GEO; GSM710417 GEO; GSM710433 GEO; GSM1669610 GEO; GSM3150236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687602
Cosmic; 910919 Cosmic; 1515186 Cosmic; 1588556 IARC_TP53; 21189 IARC_TP53; 23656 Progenetix; CVCL_1079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD012087
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |