Cellosaurus MCF-10A (CVCL_0598)
Cell line name | MCF-10A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MCF 10A; MCF.10A; MCF10A; MCF10-A; MCF10a; MCF-10 Attached; Michigan Cancer Foundation-10A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0598 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: MCF-10A (RRID:CVCL_0598) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Patented cell line. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: JWGray breast cancer cell line panel. Part of: ICBP43 breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Registration: International Depositary Authority, American Type Culture Collection (ATCC); CRL-10317. Doubling time: 97.4 hours (PubMed=24389870); 20 hours (PubMed=34238275); 26.74 hours (JWGray panel). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=12661003). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Exosome proteome analysis. Omics: Glycoproteome analysis by proteomics. Omics: H2BK120ub ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K23ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K36me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K8ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Metabolome analysis. Omics: N-glycan profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Breast, epithelium; UBERON=UBERON_0008367. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_3633 (MCF-10F) Children:
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Sex of cell | Female | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 36Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Spontaneously immortalized cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0006015/4976; ATCC=CRL-10317; CCRID; PubMed=25877200; PubMed=28889351; PubMed=29444910; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://strap.nci.nih.gov/celline_detail.php?sample_id=81 https://lincs.hms.harvard.edu/resources/reagents/icbp43/ https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 https://tcpaportal.org/mclp/ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1975513 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50009-5 Patent=US5436152 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=15153330; DOI=10.1593/neo.3292; PMCID=PMC1502105 PubMed=15375546; DOI=10.3892/ijo.25.4.961 PubMed=16271952; DOI=10.1016/j.cancergencyto.2005.04.019 PubMed=17157791; DOI=10.1016/j.ccr.2006.10.008; PMCID=PMC2730521 PubMed=17334996; DOI=10.1002/gcc.20438 PubMed=19582160; DOI=10.1371/journal.pone.0006146; PMCID=PMC2702084 PubMed=20169162; DOI=10.1371/journal.pone.0009201; PMCID=PMC2821407 PubMed=22414580; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-11-3711 PubMed=24009699; DOI=10.1371/journal.pone.0072704; PMCID=PMC3751845 PubMed=24094812; DOI=10.1016/j.ccr.2013.08.020; PMCID=PMC3931310 PubMed=24162158; DOI=10.1007/s10549-013-2743-3; PMCID=PMC3832776 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110; PMCID=PMC3937590 PubMed=24262153; DOI=10.1016/j.jprot.2013.11.006; PMCID=PMC3920745 PubMed=24389870; DOI=10.1038/srep03576; PMCID=PMC3880960 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=25892236; DOI=10.1016/j.celrep.2015.03.050; PMCID=PMC4425736 PubMed=26055192; DOI=10.1021/acs.jproteome.5b00375 PubMed=26218769; DOI=10.1016/j.jchromb.2015.07.021 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=28287265; DOI=10.1021/acs.jproteome.6b00470; PMCID=PMC5557415 PubMed=28596718; DOI=10.1007/s11306-017-1213-z; PMCID=PMC5438430 PubMed=28889351; DOI=10.1007/s10549-017-4496-x PubMed=29273624; DOI=10.1101/gr.226019.117; PMCID=PMC5793780 PubMed=29444910; DOI=10.1530/ERC-17-0445; PMCID=PMC5827037 PubMed=29561695; DOI=10.1080/15384047.2018.1449612; PMCID=PMC5989806 PubMed=30787054; DOI=10.1158/1055-9965.EPI-18-1132; PMCID=PMC6548687 PubMed=32782317; DOI=10.1038/s41598-020-70393-4; PMCID=PMC7419295 PubMed=34238275; DOI=10.1186/s12885-021-08511-2; PMCID=PMC8268371 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0006015/4976
ATCC; CRL-10317 BCRJ; 0161 CLS; 305026 IBRC; C10788 IZSLER; BS CL 174 KCB; KCB 2014066YJ NCBI_Iran; C609 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007599
MCCL; MCC:0000305 cancercelllines; CVCL_0598 CCRID; 1101HUM-PUMC000406 CCRID; 3101HUMSCSP575 DepMap; ACH-001357 IGRhCellID; MCF10A LINCS_HMS; 50583 LINCS_LDP; LCL-2085 Lonza; 131 TOKU-E; 2378 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001939 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471375
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CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 40 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307364
ChEMBL-Targets; CHEMBL614321 PharmacoDB; MCF10A_891_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0598 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54904280 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0001200 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1136376
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PRIDE; PXD000593 PRIDE; PXD000691 PRIDE; PXD003370 PRIDE; PXD005339 PRIDE; PXD008222 PRIDE; PXD009668 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Entry history | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 46 |