Cellosaurus SW1353 (CVCL_0543)
Cell line name | SW1353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-1353; SW 1353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW1353 (RRID:CVCL_0543) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: MD Anderson Cell Lines Project. From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Population: Caucasian. Karyotypic information: Hyperdiploid, 47,XX,+7 (ATCC=HTB-94). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: Ribosome profiling. Omics: Secretome proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bone, right humerus; UBERON=UBERON_0000976. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Primary central chondrosarcoma (NCIt: C7155) Chondrosarcoma (ORDO: Orphanet_55880) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 72Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-94; CLS=300440; IZSLER=BS TCL 213; PubMed=19787792; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 DOI=10.1007/978-94-011-3550-4_4 PubMed=15950496; DOI=10.1016/j.joca.2005.04.004 PubMed=19787792; DOI=10.1002/gcc.20717 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22057234; DOI=10.1038/ng.1004; PMCID=PMC3427908 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27231123; DOI=10.1158/2159-8290.CD-15-1442; PMCID=PMC5458737 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29853780; DOI=10.1155/2018/3082526; PMCID=PMC5964616 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-94
BCRC; 60548 BCRJ; 0382 CLS; 300440 ICLC; HTL99008 IZSLER; BS TCL 213 NCBI_Iran; C571 Ubigene; YC-C105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009186
CLO; CLO_0009210 MCCL; MCC:0000443 CLDB; cl4957 cancercelllines; CVCL_0543 CCRID; 3101HUMTCHu128 Cell_Model_Passport; SIDM01766 DepMap; ACH-000418 IGRhCellID; SW1353 Lonza; 85 TOKU-E; 3213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472765
BioSample; SAMN10988195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307462
ChEMBL-Targets; CHEMBL614944 PharmacoDB; SW1353_1525_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-7466 GEO; GSM887666 GEO; GSM888758 GEO; GSM1670499 GEO; GSM1676319 GEO; GSM1701652 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 923378
Cosmic; 1602475 Cosmic; 1992321 IARC_TP53; 27036 LiGeA; CCLE_285 Progenetix; CVCL_0543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD012985
PRIDE; PXD024953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |