Cellosaurus IMR-90 (CVCL_0347)
Cell line name | IMR-90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | IMR 90; IMR90; Institute for Medical Research-90; I90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: IMR-90 (RRID:CVCL_0347) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: ENCODE project common cell types; tier 2. Part of: International Histocompatibility Workshop cell lines. Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Population: Caucasian. Senescence: Capable of attaining 58 population doublings before the onset of senescence (ATCC=CCL-186). Omics: Deep proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: H2A.Z ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2AK5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2AK9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK120ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK12ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK15ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK20ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K14ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K18ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K23ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K36me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K56ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K20me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K8ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K91ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: IRM-90; Note=Occasionally. Derived from site: In situ; Fetal lung; UBERON=UBERON_0005597. Cell type: Fibroblast of lung; CL=CL_0002553. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 16FW | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Finite cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-186; IZSLER=BS CL 107; JCRB=JCRB9054; KCLB=10186; PubMed=11416159; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/IMR90_Stam_protocol.pdf https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/i/cell-lines-detail-246.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=841339; DOI=10.1126/science.841339 PubMed=211143; DOI=10.1128/jcm.7.4.368-371.1978; PMCID=PMC274969 PubMed=738322; DOI=10.1080/03610737808257154 PubMed=535915; DOI=10.1007/BF02618249 CLPUB00387 PubMed=6256643; DOI=10.1038/288724a0 PubMed=7253718; DOI=10.1016/0047-6374(81)90027-0 PubMed=7065527; DOI=10.1164/arrd.1982.125.2.222 PubMed=6887978; DOI=10.1016/0047-6374(83)90043-x PubMed=6525431 PubMed=6538202; DOI=10.1083/jcb.98.3.1133; PMCID=PMC2113122 PubMed=3335022 PubMed=1574572; DOI=10.2307/3578273 CLPUB00597 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 CLPUB00499 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22108792; DOI=10.1038/msb.2011.84; PMCID=PMC3261715 PubMed=23325432; DOI=10.1101/gr.147942.112; PMCID=PMC3589544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; P0016019/4978
ATCC; CCL-186 ATCC; CRL-7931 - Discontinued BCRC; 60204 BCRJ; 0118 CLS; 305216 - Discontinued Coriell; I90-10 Coriell; I90-15 Coriell; I90-19 Coriell; I90-24 Coriell; I90-26 Coriell; I90-33 Coriell; I90-40 Coriell; I90-52 - Discontinued Coriell; I90-53 Coriell; I90-78 - Discontinued Coriell; I90-79 Coriell; I90-83 ECACC; 85020204 IZSLER; BS CL 107 JCRB; JCRB0516 JCRB; JCRB9054 KCB; KCB 2017066YJ KCLB; 10186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0006951
CLO; CLO_0029276 CLO; CLO_0029279 CLO; CLO_0029284 CLO; CLO_0029291 CLO; CLO_0029294 CLO; CLO_0029328 CLO; CLO_0029330 CLO; CLO_0029331 CLO; CLO_0029332 CLO; CLO_0029336 MCCL; MCC:0000243 CLDB; cl2889 CLDB; cl2890 cancercelllines; CVCL_0347 CCRID; 3101HUMSCSP5013 CCRID; 5301HUM-KCB17066YJ IPD-IMGT/HLA; 11782 Lonza; 745 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSRI51KRED
4DN; 4DNSRXXGU3CH BioSample; SAMN03471461 BioSample; SAMN03472414 ENCODE; ENCBS007TVF ENCODE; ENCBS048GPK ENCODE; ENCBS048TNH ENCODE; ENCBS073JZM ENCODE; ENCBS192DLO ENCODE; ENCBS275EWD ENCODE; ENCBS357USI ENCODE; ENCBS361XFK ENCODE; ENCBS364NFD ENCODE; ENCBS368ENC ENCODE; ENCBS369ENC ENCODE; ENCBS370ENC ENCODE; ENCBS371ENC ENCODE; ENCBS371NWL ENCODE; ENCBS372ENC ENCODE; ENCBS373ENC ENCODE; ENCBS379ENC ENCODE; ENCBS410ENC ENCODE; ENCBS411ENC ENCODE; ENCBS412ENC ENCODE; ENCBS412SDE ENCODE; ENCBS413ENC ENCODE; ENCBS414ENC ENCODE; ENCBS415ENC ENCODE; ENCBS416ENC ENCODE; ENCBS460CLV ENCODE; ENCBS470SXX ENCODE; ENCBS472JFT ENCODE; ENCBS486FIC ENCODE; ENCBS532ZGJ ENCODE; ENCBS562LLK ENCODE; ENCBS598YLQ ENCODE; ENCBS648SCY ENCODE; ENCBS683AVF ENCODE; ENCBS754TWW ENCODE; ENCBS780OTZ ENCODE; ENCBS981IKS ENCODE; ENCBS981UBX ENCODE; ENCBS982GUC ENCODE; ENCBS992YMT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307985
ChEMBL-Targets; CHEMBL612577 PubChem_Cell_line; CVCL_0347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54897669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0001196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM432687
GEO; GSM432688 GEO; GSM432689 GEO; GSM432690 GEO; GSM432691 GEO; GSM432692 GEO; GSM438363 GEO; GSM438364 GEO; GSM468792 GEO; GSM468801 GEO; GSM469965 GEO; GSM469966 GEO; GSM469967 GEO; GSM469968 GEO; GSM469970 GEO; GSM469973 GEO; GSM469974 GEO; GSM469975 GEO; GSM521866 GEO; GSM521868 GEO; GSM521869 GEO; GSM521870 GEO; GSM521871 GEO; GSM521873 GEO; GSM521874 GEO; GSM521875 GEO; GSM521877 GEO; GSM521878 GEO; GSM521879 GEO; GSM521880 GEO; GSM521881 GEO; GSM521883 GEO; GSM521884 GEO; GSM521885 GEO; GSM521886 GEO; GSM521887 GEO; GSM521889 GEO; GSM521890 GEO; GSM521892 GEO; GSM521893 GEO; GSM521894 GEO; GSM521895 GEO; GSM521897 GEO; GSM521898 GEO; GSM521899 GEO; GSM521900 GEO; GSM521901 GEO; GSM521902 GEO; GSM521903 GEO; GSM521904 GEO; GSM521906 GEO; GSM521907 GEO; GSM521908 GEO; GSM521909 GEO; GSM521911 GEO; GSM521912 GEO; GSM521913 GEO; GSM521914 GEO; GSM521915 GEO; GSM521917 GEO; GSM521918 GEO; GSM521919 GEO; GSM521921 GEO; GSM521922 GEO; GSM521923 GEO; GSM521924 GEO; GSM521925 GEO; GSM521926 GEO; GSM521927 GEO; GSM521928 GEO; GSM521929 GEO; GSM521930 GEO; GSM521931 GEO; GSM521932 GEO; GSM521933 GEO; GSM530665 GEO; GSM530666 GEO; GSM541279 GEO; GSM541280 GEO; GSM604470 GEO; GSM604471 GEO; GSM723024 GEO; GSM752986 GEO; GSM752987 GEO; GSM818007 GEO; GSM818008 GEO; GSM818012 GEO; GSM818013 GEO; GSM818017 GEO; GSM827198 GEO; GSM832837 GEO; GSM832838 GEO; GSM862724 GEO; GSM892307 GEO; GSM909321 GEO; GSM909338 GEO; GSM909339 GEO; GSM923447 GEO; GSM927235 GEO; GSM935403 GEO; GSM935404 GEO; GSM935513 GEO; GSM935519 GEO; GSM935624 GEO; GSM942307 GEO; GSM942928 GEO; GSM959044 GEO; GSM1003612 GEO; GSM1003613 GEO; GSM1003614 GEO; GSM1003615 GEO; GSM1003623 GEO; GSM1008586 GEO; GSM1055800 GEO; GSM1055801 GEO; GSM1068140 GEO; GSM1068141 GEO; GSM1154021 GEO; GSM1154022 GEO; GSM1154023 GEO; GSM1154024 GEO; GSM1186664 GEO; GSM1296454 GEO; GSM1463270 GEO; GSM2988906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Progenetix; CVCL_0347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |