Cellosaurus EFO-21 (CVCL_0029)
Cell line name | EFO-21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | EFO 21; EFO21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: EFO-21 (RRID:CVCL_0029) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: 42 hours (PubMed=25984343); ~40-60 hours (DSMZ=ACC-235); 43.71 hours (JWGray panel). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=12661003; Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep antibody staining analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Ovarian serous cystadenocarcinoma (NCIt: C7978) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 56Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=911905; DSMZ=ACC-235; PubMed=30485824 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.proteinatlas.org/learn/cellines https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6405069; DOI=10.1093/jnci/70.5.839 PubMed=12661003; DOI=10.1002/gcc.10196 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23839242; DOI=10.1038/ncomms3126; PMCID=PMC3715866 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30485824; DOI=10.1016/j.celrep.2018.10.096; PMCID=PMC6481945 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002892
CLDB; cl1142 cancercelllines; CVCL_0029 Cell_Model_Passport; SIDM01052 Cosmic-CLP; 911905 DepMap; ACH-000308 DSMZCellDive; ACC-235 LINCS_LDP; LCL-1515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473384
BioSample; SAMN10988346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308730
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075440 GDSC; 911905 PharmacoDB; EFO21_325_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54832065 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM274698 GEO; GSM659374 GEO; GSM711716 GEO; GSM887000 GEO; GSM888069 GEO; GSM1669756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 911905
Cosmic; 1305325 Cosmic; 1707571 IARC_TP53; 21322 LiGeA; CCLE_252 Progenetix; CVCL_0029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |