Cellosaurus D341 Med (CVCL_0018)
Cell line name | D341 Med | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | D-341 Med; D-341 MED; D-341 Med-C; D-341Med; D-341MED; D341_Med; D341Med; D341MED; D341MD; D-341; D341; Med 341; H341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: D341 Med (RRID:CVCL_0018) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Population: Caucasian. Doubling time: 37 hours (ATCC=HTB-187). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Transcriptome analysis by serial analysis of gene expression (SAGE). Miscellaneous: The values for the STR markers F13A01, F13B, FESFPS and LPL used to be shown on the ATCC website but are no longer displayed (see Internet archive link for archival version). Derived from site: In situ; Brain, cerebellum; UBERON=UBERON_0002037. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Medulloblastoma, non-WNT/non-SHH, group 3 (NCIt: C129445) Medulloblastoma (ORDO: Orphanet_616) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 3Y5M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-187; CCRID=1101HUM-PUMC000102 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/MedulloD341_Crawford_protocol.pdf https://web.archive.org/web/20160611152450/http://www.atcc.org:80/products/all/HTB-187.aspx#specifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3279793; PMCID=PMC1880676 PubMed=2180567 PubMed=1822845 PubMed=8275086; DOI=10.1038/ng1193-230 DOI=10.1007/0-306-46861-1_11 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=20847082; DOI=10.1093/neuonc/noq091; PMCID=PMC3018940 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=27498314; DOI=10.1016/j.jbiotec.2016.07.028 PubMed=27812533; DOI=10.1016/j.dib.2016.10.004; PMCID=PMC5079239 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31963405; DOI=10.3390/cancers12010226; PMCID=PMC7016648 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-187
CLS; 305136 KCB; KCB 2010239YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002677
cancercelllines; CVCL_0018 CCRID; 1101HUM-PUMC000102 Cell_Model_Passport; SIDM01492 DepMap; ACH-000095 IGRhCellID; D341Med | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472737
BioSample; SAMN10988120 ENCODE; ENCBS254AAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308450
ChEMBL-Targets; CHEMBL614478 PharmacoDB; D341Med_280_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54817217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002157 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM383763 GEO; GSM482333 GEO; GSM827339 GEO; GSM886970 GEO; GSM888039 GEO; GSM918117 GEO; GSM919358 GEO; GSM1008577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 923657
Cosmic; 973263 Cosmic; 974282 Cosmic; 975025 Cosmic; 1097759 Cosmic; 2362652 Cosmic; 2731178 Cosmic; 2772984 IARC_TP53; 30029 LiGeA; CCLE_586 Progenetix; CVCL_0018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |